Niektóre drzewka i krzewy wymagają w zimie temperatury 0-10°C. Należą do nich rośliny nieodporne na mróz, a spośród odpornych te, które są kształtowane w stylu skalnym, niedawno przesadzane, uprawiane w małych pojemnikach, młode, z cienkimi pniami i gałęziami oraz rośliny kwitnące lub owocujące zimą. Najlepsza do przetrzymywania ich w zimie jest nie ogrzewana szklarnia. Może to jednak być jasne i chłodne pomieszczenie w domu, klatka schodowa lub składzik. Pomieszczenia, w których rośliny są przetrzymywane, powinny być jasne i mieć temperaturę 0-10°C. Nie wolno przechowywać roślin w pomieszczeniach zawierających szkodliwe gazy, np. w garażu. Drzewka trzeba wynosić na zewnątrz w czasie ładnej pogody i dobrze jest przetrzymać je tam 1-2 dni, jeśli temperatura jest bliska zeru. Rośliny trzeba 2 razy w tygodniu opryskać wodą, w przeciwieństwie do drzewek zimujących na zewnątrz lub pod folią, których się nie zrasza. Utrzymywanie odpowiedniej temperatury w pomieszczeniach jest ważne, gdyż zbyt wysoka temperatura może spowodować zakłócenia spoczynku roślin, a w związku z tym osłabienie kwitnienia lub jego brak.

Od wielu lat próbuje się wykorzystać do tworzenia bonsai rośliny uprawiane w mieszkaniach. Z roślin tych tworzy się bonsai do mieszkań, tzw. indoor bonsai, które są już popularne w Stanach Zjednoczonych i od kilku lat znane w Europie. Do tego celu nadają się wszystkie rośliny pokojowe o drobnych liściach i zdrewniałych pniach i konarach. Z powodzeniem można uprawiać jako bonsai niektóre rośliny tropikalne, wymagające w ciągu całego roku temperatury powyżej 15°C, np. niektóre gatunki fikusa (Ficus), gardenii (Gardenia) czy Szefler (Schefflera).

Materiału na bonsai możemy też poszukać wśród roślin uprawianych w mieszkaniach, a wymagających zimą niższych temperatur. Jeżeli uda nam się zimą zapewnić roślinom temperaturę około 8-12°C, to z powodzeniem możemy uprawiać jako indoor bonsai takie gatunki, jak: kamelia japońska (Camellia japonica), grubosz drzewiasty (Crassula arborescens), bluszcz pospolity (Hedera helix) i wiele innych. Dla tych roślin najlepsze są jasne, chłodne wnętrza. W czasie lata można jest wystawić na zewnątrz, a zabrać je z powrotem, gdy nocna temperatura jesienią obniży się do 5°C.

Dobrym miejscem dla bonsai w mieszkaniach jest parapet okienny. Są one tam dobrze oświetlone, a zimą mają niższą temperaturę niż w miejscu oddalonym od okna. Najlepsze jest okno z wystawą południową. Bonsai ustawia się nie bezpośrednio na parapecie, lecz na półkach. Jest to konstrukcja prosta, zapewniająca roślinom dobre warunki i jednocześnie podnosząca atrakcyjność wnętrza.

Uprawiając rośliny pokojowe jako bonsai należy wszystkie zabiegi stosowane w tej sztuce połączyć z wymaganiami poszczególnych gatunków roślin opisanymi w literaturze dotyczącej roślin pokojowych.